[ترانيم الكفاح]

المشاركة الأصلية كتبت بواسطة راوين من جديد ترانيم الكفاح....جزاك ربي الجنة ماقصرتي والله فديتك يالغلا ربي يحقق لك جميع امنياتك آسسفه اذا اتعبتك امم ممكن تشرحين لي دي كمان<<<ماتنعطى وجه active site is 3-dimensional entity كمان ذا ماقدرت افهمهserine proteases وبرضو دي الجزئية حسيتها كلام كثيرر non-protein biocatalysts-ribozymes وجزاك ربي كل ماتتمنين والله احضر معها كل محاضرة واحاول افهم منها شئ لكن والله ماتششرح مضبووط وتبغى تجيب اسئلة على الفهم طيب اشرحي كوييسس بعدين حطي اسئلة على قد شرحك وتعبك موو جالسسه وتعرض على البور حسسسسبي الله بسسس تسلمييين حبيبة قلبي والله انتظرك حياتي راوين

3-dimentional entity
اي مثل ما قلت لك انو الانزيم بيكون في الوضعيه الثلاثيه الشكل (لما بتشوفيه تحت المجهر حتلاقيه ثلاثي الشكل وليس في خط مستقيم )
فالموقع النشط للانزيم بيكون intricate pocket or cleft structurally
( جيوب او شقوق معققده ) فهذا شيء طبيعي لكي يلائم الوضع الثلاثي الشكل للانزيم

The residues which constitute the active site are often not close to each other in the primary sequence,(هذا يعني انو البقايا من العناصر التي تكون الموقع النشط في الانزيم لا تكون ملتفه حول بعظها عندما تكون في الشكل البسيط الاحادي المجال اي سلسله واحده اي لما بيكون عندي primary sequence)

but the tertiary fold brings them close together in three-dimensional space.
ولكن ترتبط وتلتف حول بعضها عندما يكون عندي الانزيم في الوضع الثلاثي اي اكثر من سلسله ملتفه حول بعضها

Active sites often involve residues on connecting loops between helices and sheets, rather than those which are part of these regular secondary structures.
لما بيكون عندي شكل ثنائي اي سلسلتين ملتفتين حول بعظها فان الموقع النشط يتكون عندما يحصل ارتباط بين helices و sheets وهذا لايكون الا في الثنائي الشكل .

In many instances, active sites occur at the junction between 2 domains making tertiary contacts.

ولكن في اغلــــــــــــــب الاوضاع الموقع النشط للانزيم بيكون ارتباط بين مجااااااااالين اي بين مجالين لسلسله ثنائيه فيتكون عندي الهيكل الثلاثي
--------------------------------------------
serine proteses عباره عن انزيم تكون الانزيم عند مركب او حلقة السرين في السلسله الببتيديه للانزيم
ومن اقسامه التربسين والكيموتريبسين فهي تقوم بقطع الرابطه الببتيديه بين مجموعة الكربوكسيل للاحماض الامينيه في السلسله الببتيديه
انزيم التربسين يقوم بقطع الرابطه الببتيديه للمجموعة الكربوكسيل المتصله بالاحماض الامينيه القاعديه مثل اللايسين والاورقنين
basic amino acid residues like lysineor arginine

اما انزيم الكيموتريبسين هو عباره عن تربسين ولكن اقوى من التربسين لانه يقوم بقطع الرابطه الببتيديه بين محموعة الكربوكسيل المتصله بلاحماض الامينيه ال
hydrophobic الكاره للهيدروجين مثل
phenylalanine or leucine

هنا معلومه حلوه :
a) In trypsin: the pocket is deep and narrowا
الشقوق في الموقع النشط للترسبن تكون ضيقه وعميقه وسالبه الشحنه لكي تجذب المركبات الموجبة الشحنه
,( with a negatively charged carboxylate at its bottom –just the thing to catch and hold a long, positively charged side chain like lysine or arginine (of the substrate).

b) In chymotrypsin: it is wider and lined with hydrophobic residues, to accommodate a hydrophobic side chain.
اما في الكيمو تربسين فان الموقع النشط بيكون واسع وخطي عند البقايا الكارهه للماء للسلسه المرتيط بها لكي تجذب المركبات التي مثلها
-----------------------------------------
بالنسبه لسؤالك الاخير ماعرفت ايش تبغي بالضبط لكن الي ابغاك تفيهمينه :
انو الانزيم عباره عن بروتين او عناصر ترتبط بالبروتين تسمى (Holoenzyme)
وهي

Non

-protein (cofactor1

Cofactor: l ion (inorganic) or coenzyme

apoenzyme ) part protein 2

انت بتسألي عن non proten biocatlyse ribosymse
هذه عباره عن انزيم ولكنه ليس ببروتين , بل عناصر مرتبطه بالبروتين ومنها الرايبوزوم وهي احماض نوويه ترتبط بالبروتين وعندما ترتبط بالبروتين تسمى نيكليوبروتين

nucleoprotein

ياااااااااااااااااااااارب اكون افدتك وربنا معاك

واتمنى انك فهمتي شرحي لاني قاعده احاول افهمك قد ما اقدر